2017年5月 西南民族大学学报(自然科学版) Journal of Southwest Minzu University(Natural Science Edition) Mav.2017 第43卷第3期 Vo1.43 No.3 doi:10.1 1920/xnmdzk.2017.03.003 大熊猫粪便样品中犬瘟热病毒的检测 张焕容 ,徐桂丽 ,刘颂蕊 ,侯蓉 (1.西南民族大学生命科学与技术学院,四川 成都610041;2.成都大熊猫繁育研究基地,四川 成都610081) 摘要:根据GenBank中登录的犬瘟热病毒(CDV)N基因序列,设计合成1对特异性引物,以犬瘟热病毒疫苗中提取 的RNA为阳性模板建立了快速检测CDV的RT.PCR方法,结果显示,所建立的CDV RT-PCR扩增得到与理论设计值 大小一致的456 bp的特异性片段,对犬细小病毒(PPV)、猪伪狂犬病毒(PRV)、牛轮状病毒(BRV)、牛病毒性腹泻病毒 (BVDV)、大肠杆茵(E.coli)和新城疫病毒(NDV)的扩增结果均为阴性;最低可检出约1.53×10 拷贝/ L的核酸;重 复性试验结果表明,该方法检测重复性好.此方法对成都大熊猫繁育研究基地的37份眼观正常的大熊猫粪便样品检 测,未检测出犬瘟热病毒,与胶体金试纸卡检测结果一致. 关键词:犬瘟热病毒;RT—PCR;大熊猫 中图分类号:¥852.6 文献标志码:A 文章编号:2095-4271(2017)03-0237-05 Detection of canine distemper virus fromfaecal samples of giant pandas ZHANG Huan.rong ,XUGui.fi ,LIU Song.rui ,HOU Rong (1.School of Life Science and Technology,Southwest Minzu University,Chengdu 610041,P R C.; 2.Chengdu Giant Panda Breeding Research Base,Chengdu 610081,P.R.C.) Abstract:According to the published sequence of canine distemper virus(CDV)N gene in GenBank,a pair of speciifc primers was designed for the detection of CDV.The template extracted from CDV vaccine was used as positive template to establish RT- PCR detection method for CDV.After optimizing the reaction system.as few as 1.53×10 copies/ ̄L plasmid DNA of CDV spe- cific fragment could be detected accurately and rapidly.This method had good reproducibility and stability.There were no cross eractions to Canine Parvovirus,Swine Pseudorabies Viurs,Bovine Rotavirus,Bovine Viral Diarrhea Viurs,E.coli and New Cas— tie Disease Virus.This method was印plied for the detection of canine distemper virus in fecal samples of giant pandas,and the results showed that 37 normal giant panda fecal samples collected from Chengdu Research Base of Giant Panda Breeding were CDV RT—PCR negative samples,and the results were consistent with the colloidal gold strip test results. Key words:canine distemper virus;RT—PCR;giant panda 犬瘟热病毒(Canine distemper virus,CDV)感染多 科动物不同种之间存在较大的差异,其中以雪貂的易 种动物引起的一种急性、高度接触性传染病,称为犬 感性最高,发病率高达100%[7-8].随着自然环境的改 瘟热(Canine distemper,CD) J.该病呈世界性分布, 变及动物和病毒自身的进化,CDV自然感染的宿主范 不仅感染犬科动物中的犬、狼、狐狸等 引,还能感染 围也在不断扩大,给大熊猫这一濒危珍稀动物的生存 鼬科动物,例如黄鼬、貂、雪貂等及浣熊科和猫科等多 带来了极大的威胁.分子生物学的RT—PCR方法已成 种动物 .发病率和死亡率在不同科动物间,以及同 为目前检测CDV常用的方法,但即使完全相同的方 收稿日期:2016-12-20 作者简介:张焕容(1968-),女,汉族,重庆江津人,教授,博士.研究方向:动物疫病防控.E—mail:727746768@qq.com 基金项目:大熊猫繁育研究基金项目(CPF2015—03) 238 西南民族大学学报(自然科学版) 第43卷 法在不同实验室检测的灵敏度会有一定的差异.2015 便样品用DEPC水稀释后提取总RNA.将提取的总 RNA反转录合成eDNA并置-20 ̄C保存备用.以上述 cDNA为模板进行PCR反应.PCR反应总体系为 25 L,其中10×PCR Buffer 2.5 L,EX・Taq DNA聚 年初,陕西省珍稀野生动物抢救饲养研究中心圈养大 熊猫因感染犬瘟热病毒导致死亡,因此,成都大熊猫 繁育研究基地委托西南民族大学动物医学实验室对 其大熊猫粪便样品进行了CDV的检测.本研究同时 合酶(5 U/tzL)0.15 tzL,上、下游引物各0.5 izL,cD— NA 2.0 L,2.5 mmol/L dNTP 2 tzL,超纯水调整总 还采用了CDV胶体金试纸条对送检的粪便样品进行 了检测,为寻找合适的大熊猫CDV检测方法进行了 探索. 体积至25 .产物经1.5%琼脂糖凝胶电泳观察. PCR反应程序如下:94℃预变性4 min;94 oC变性 1材料与方法 1.1 大熊猫粪便样品及参考菌毒株 37份大熊猫新鲜粪便样品采自成都大熊猫繁育 研究基地,采样时取刚排出的新鲜粪便的中段,立即 放人干冰,并保证用干冰运输至实验室,至实验室后一 80 ̄C保存待检;犬瘟热疫苗(Canine Distemper Vae- cine,MERIAL,RM2170R1)由成都大熊猫繁育研究基 地提供;犬细小病毒(CPV)、猪伪狂犬病毒(PRV)、牛 轮状病毒(BRV)、牛病毒性腹泻粘膜病病毒 (BVDV)、大肠杆菌(E.coli)、新城疫病毒(NDV)均由 西南民族大学动物医学实验室分离保存. 1.2主要试剂 Trizol购自Invitrogen公司;反转录试剂盒和 pMD19一T载体购自大连宝生物工程有限公司;DNA 分子量标准均购白天根生化科技(北京)有限公司;胶 回收试剂盒与质粒提取试剂盒均购自美国OMEGA 公司;感受态细胞E.coli.DH5a、EX—Taq DNA聚合酶 和dNTP均购自TaKaRa公司;犬瘟热病毒胶体金检 测试纸卡购自上海快灵公司. 1.3 CDV RT—PCR方法的建立 1.3.1 引物设计与合成 根据GenBank中登录CDV基因序列,利用Prim— er 5.0软件设计1对特异性引物,上游引物:5: CGAGTC1rITGAGATAGGGTr_3,,下游引物:5"-CCTC- CAAAGG(邢’CCCATGA一3 i l.3.2 RNA的提取与扩增 将犬瘟热病毒疫苗、参考菌毒株和待检大熊猫粪 30 S、54℃退火30 S、72 oC延伸40 S,共40个循环; 72℃延伸8 min. 1_3.3 PCR产物的纯化与克隆 按常规方法纯化PCR产物和克隆,克隆阳性菌 落增菌后送公司测序. 1.3.4 PCR特异性试验 分别取BRV、BVDV和NDV的反转录产物及E. coli、PRV、CPV抽提的DNA作为模板进行PCR扩 增. 1.3.5 PCR敏感性试验 l0 一10 倍系列稀释的包含CDV目的基因片段 的质粒模板经PCR扩增,确定PCR方法的敏感性. 1.3.6 PCR重复性及稳定性试验 对CDV阳性和阴性核酸用建立的PCR检_2贝4方法 分别批内和批间重复检测3次. 1.4大熊猫粪便样品的RT—PCR检测 将成都大熊猫繁育研究基地送检的37份粪便样 品eDNA用建立的PCR方法进行检测. 1.5大熊猫粪便样品的胶体金检测卡检测 按上海快灵公司的CDV胶体金检测卡说明书要 求,对成都大熊猫繁育研究基地送检的37份粪便样 品进行检测. 2结果与分析 2.1 CDV eDNA的PCR扩增结果 运用设计的特异性引物从犬瘟热疫苗提取的总 RNA反转录获得的cDNA中经PCR扩增出了大约 500 bp的片段,与预期扩增片段大小一致(图1). 第3期 张焕容,等:大熊猫粪便样品中犬瘟热病毒的检测 M N l 2 3 239 600 500 400 300 56 200 100 图1 CDV目的片段的PCR扩增结果 M:DNA分了质 标准;N:阴性对照;】~3:CDV口的基因PCR扩增产物 Fig.1 PCl ̄ampliicatifon result of CDV target gene M:DNA Marker I:N:Negative Control:1.2 and 3:PCR amplification product of CDV target gene 2.2 扩增产物克隆及测序鉴定结果 扩增的目的片段同收后克隆于pMDI9一T载体获 得的阳性克隆经质粒PCR鉴定,结果扩增出约500 bp的特异性条带.阳性质粒序列测定结果 GenBank 中收录的犬瘟热序列 源性为100%. 2.3 PCR方法的特异性 分别取BRV、BVDV和NDV的RNA反转录产物 cDNA进行PCR,提取E.coli、PRV、CPV的DNA以及 CDV阳性质粒进行PCR,结果只有CDV阳性质粒能 够扩增出目的条带,其他病毒均未扩增出条带(图 2). M N l 2 3 4 5 6 7 bp l2【10 嚣 300 100 图2 CI)V目的片段阳性克隆质粒的PCR扩增结果 M:DNA分 质』}}标准:N: 性刈_l!f{;】:CDV ]lrj 质粒;2:PRV;3:PPV;4:BRV;5:BVDV;6:E coil;7:NDV Fig.2 Ampliif(,ation result I1f CDV target gene recombinant plasmid 2.4 PCR方法的敏感性 陔PCR方法最低检f』J量为1.53×l0 拷Oq./ ̄i 的质粒DNA(图3). 240 西南民族大学学报(自然科学版) 第43卷 M 2 3 蘑5 零 拿 :, 虫合蛋宴 、 ‘ )[9…-1 1i。,… ̄ cDv 行特异、灵敏、快速的榆测,与商 化的堆于 足D 竺 皇著 兰警 c v 姜挺釜菇 澳 。 痞銮 繁譬白l 12-14 ,是要 C保护性 警曼 妻 果町 吴 ‘ 。 l ̄ . 12 体产生较强的抗体反应发挥体液免疫功能 黧能16i刺 . Pa sca…DV N. …、…,荔 一 ~ “~ 的方 …… 一 !一…… 第3期 张焕容,等:大熊猫粪便样品中犬瘟热病毒的检测 241 [3]CUNNINGHAM,SHINDLE,ALLISON,eta1.Canine distemper epizootic in everslades mink[J].Journal of wildlife Diseases,2009,45(4): l150.1 157. [4]GORDON C H,BANYARD A C,HUSSEIN A,et a1.Canine distemper in Endangered Ethiopian Wolves[J].Emerging Infectious Diseases, 2015。21(5):824 ̄32. 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