案件移交检察院了，被扣押的手机不一定会移交给检察院。移送检察院的话需要证明本人所涉及的案例已经涉及刑事犯罪了，需要移送检察院进行批捕，其次是扣押的手机与案件本身有厉害关系，是犯罪工具或者是主要证据才能一并移送到检察院，否则不能擅自移送。根据法律规定，公安机关侦查终结的案件，应当做到犯罪事实清楚，证据确实、充分，并且写出起诉意见书，连同案卷材料、证据一并移送同级人民检察院审查决定;同时将案件移送情况告知犯罪嫌疑人及其辩护律师。,法律依据,《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百六十二条 公安机关侦查终结的案件，应当做到犯罪事实清楚，证据确实、充分，并且写出起诉意见书，连同案卷材料、证据一并移送同级人民检察院审查决定;同时将案件移送情况告知犯罪嫌疑人及其辩护律师。犯罪嫌疑人自愿认罪的，应当记录在案，随案移送，并在起诉意见书中写明有关情况。
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