学籍和实际就读的学校不在同一个学校是有影响的。这种情况属于人籍分离，这是明令禁止的，教育部中小学生学籍管理办法中明确规定，不允许学生人籍分离。人籍分离对学生高考报名资格，家庭困难学生补助等方面有很大的影响，在高考报名中人籍分离是要回到学籍所在学校报考的，非常麻烦，而且毕业证也不能办理。人籍分离的学生不能享受家庭困难学生补助，已经发放的补助需要退回到资助中心。办理要求根据《普通高等学校学生管理规定》，按照国家招生规定录取的新生，持录取通知书，到校办理入学手续，复查合格者予以注册，取得学籍。复查不合格者，由学校区别情况，予以处理，直至取消入学资格。凡属弄虚作假、徇私舞弊取得学籍者，一经查实，取消学籍。冒名顶替取得学籍并获得证书者，一经查实，追回证书，并在教育部指定的学历证书查询网站上撤销学历证书电子注册信息。未经省级招生部门录取的学生，不管其在校学习时间多长，均无学籍。即使修业期满，成绩合格，也不能获得国家承认的普通高等教育学历证书。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国教育法》第九条中华人民共和国公民有受教育的权利和义务。公民不分民族、种族、性别、职业、财产状况、宗教信仰等，依法享有平等的受教育机会。
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