FPD检测器是通过氢气与空气形成的火焰将从色谱柱流出的含磷/硫有机化合物燃烧，生成HPO或者S=S，特定波长的光波通过滤光片到达光电倍增管（PMT），产生放大的电信号，被信号板记录传输到数据工作站。 含磷化合物燃烧生成HPO分子，产生526nm光波，与浓度成线性相关。 含硫化合物燃烧生成S=S 分子，产生394nm 光波，非线性响应，与硫原子浓度的平方成正比。
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